CleanPlex即用型NGS面板用于靶向测序

下一代测序（NGS）是一种DNA测序技术，它彻底改变了基因组研究。使用NGS，可以在一天之内对整个人类基因组进行测序。CleanPlex NGS面板由Paragon Genomics的CleanPlex技术提供技术支持，该技术使用专有的多重PCR背景清洁化学技术来有效去除非特异性PCR产物，从而实现一流的靶标富集性能和高效利用测序读数。CleanPlex即用型NGS面板经过专业优化，可生成有价值的见解。

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CleanPlex技术

什么是目标测序（重测序）/目标富集？

靶向测序或重测序是一种仅对整个基因组或目标区域的一部分进行测序而不对样品的整个基因组进行测序的方法。为了仅关注基因组或DNA样品的特定或临床相关区域，需要进行称为靶标富集的预测序DNA制备步骤，在该步骤中直接扩增（基于扩增子或基于多重PCR的）或捕获（杂交）靶DNA序列基于捕获的序列），然后使用DNA测序仪进行测序。

为什么要进行目标富集？

全基因组测序（WGS）及其相应的全基因组扩增（WGA）方法更适合研究和发现类型的应用，而靶向测序和靶标富集对于许多快速增长的临床和工业应用是必不可少的，而这些领域的成本和速度都更高。重要的。

CleanPlex NGS目标富集扩增子测序技术：

CleanPlex技术是基于超高倍PCR扩增子的靶标富集技术，用于NGS靶向测序（扩增子测序，而不是基于杂交捕获的测序）。它具有高度先进的专有引物设计算法，异常均匀的多重PCR扩增化学和创新的专利背景清洁化学。它们一起使CleanPlex即用型和定制NGS面板突破了现有基于PCR扩增子和基于杂交捕获的靶标富集技术的极限。

功能亮点：

• 超高扩增均匀性和超低PCR背景噪音（更准确的变异调用或更少的测序成本）
• 单管和3小时工作流程，动手时间最短（自动化程度高）
• 与困难的样品（降解的FFPE，cfDNA）和主要的测序平台（Illumina，Ion Torrent，MGISeq）兼容
• 极高的灵敏度（低至单细胞水平直接扩增）
• 单个多重PCR池中出色的面板尺寸可扩展性，从几个扩增子到超过20,000个扩增子

基于CleanPlex多重PCR的NGS目标富集工作流程：

CleanPlex即用型和定制NGS面板可轻松快速地制备高质量的，富含靶标的NGS库，用于扩增子测序。

CleanPlex后台清洁化学剂：

CleanPlex的化学过程涉及3个简单的步骤，每个步骤都包括一个热循环或孵育反应，然后使用磁珠纯化文库。简化的协议仅需3个小时即可完成。在步骤1中，在多重PCR反应中扩增目标靶标。在步骤2中，在消化反应中通过生物化学方法去除引物二聚体，非特异性PCR产物和复杂的分子碎片。在第3步中，将文库与样品索引一起条形码化，并在PCR反应中进行扩增。

后台清洁助力高性能

使用专有的CleanPlex消化化学方法可生化去除非特异性PCR产物和引物二聚体。这样可确保仅将感兴趣的DNA序列转换为NGS文库分子，从而可高效利用测序读数。

有效去除PCR背景。使用CleanPlex消化试剂，使用CleanPlex OncoZoom Cancer Hotspot Panel（带有蓝色痕迹或不带有红色痕迹）使用CleanPlex消化试剂制备文库，并使用AgilentBioanalyzer®进行检查。如果不使用CleanPlex消化，则会形成大量的PCR背景，这将导致较低的定位速率和较弱的靶向率，并且需要进行更多的测序读取才能获得足够的数据。通过CleanPlex消化，几乎没有背景产生，在Bioanalyzer迹线中产生了清晰而干净的库峰。专有的CleanPlex消化化学对于去除目标序列的多重PCR扩增过程中形成的不良副产物至关重要。

事半功倍

出色的引物设计与创新的文库制备化学相结合，使CleanPlex NGS目标富集板具有 超高的多路复用能力， 高性能， 低输入量要求， 高灵敏度， 单管工作流程和 经济高效的扩增子测序。这些非凡的功能和优势使研究人员和化验开发人员可以事半功倍地发现更多信息。

• 每个反应多个20,000+个扩增子
• 目标设计率高
• 高覆盖均匀度
• 高准率
• 高灵敏度（输入为10 ng时LOD为1％）

使用更少的投入和资源来降低成本

• 输入低至10 ng
• 3小时快速协议
• 简单，简化的工作流程
• 有效利用NGS读取